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ScCompass: 迄今为止体量最大的跨物种单细胞测序数据库
来源: | 作者:百曜(北京)科技有限公司 | 发布时间 :2025-03-05 | 147 次浏览: | 分享到:

    scCompass提供了一种数据质量解决方案,用于构建大规模、跨物种和模型友好的单细胞数据集。通过应用标准化数据预处理,scCompass 整合和管理了来自 13 个物种和近 1.05 亿个单细胞的转录组数据。使用这个广泛的数据集,我们能够存档人和小鼠的稳定表达基因 (SEG) 和器官特异性表达基因 (OSG)。我们提供不同的可扩展数据集,这些数据集可以轻松适应 AI 模型训练和具有最先进 (SOTA) 单细胞基础模型的预训练检查点。总之,scCompass 的 AI 就绪性与用户友好的数据共享、可视化和在线分析相结合,大大简化了单细胞生物学研究人员的数据访问和开发。


参考资料:

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.11.12.623138v1

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